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Genome sequence of the clover-nodulating Rhizobium leguminosarum bv. trifolii strain SRDI943

机译:三叶草结节的豆科根瘤菌的基因组序列。三叶草菌株SRDI943

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摘要

Rhizobium leguminosarum bv. trifolii SRDI943(syn. V2-2) is an aerobic, motile, Gram-negative, non-spore-forming rod. SRDI943was isolated from a nodule recovered from the roots of the annual clover Trifoliummichelianum savi cv. paradanathat had been inoculated with a soil collected from a mixed pasture in Victoria, Australia. SRDI943 has a broadhost range for nodulation within the clover genus, however N2-fixationis sub-optimal (20-54% of reference strain WSM1325) on T. subterraneum spp.Here we describe the features of R. leguminosarum bv. trifolii strain SRDI943, together with genomesequence information and annotation. The 7,412,387 bp high-quality-draft genomeis arranged into 5 scaffolds of 5 contigs, contains 7,317 protein-coding genesand 89 RNA-only encoding genes, and is one of 100 rhizobial genomes sequencedas part of the DOE Joint Genome Institute 2010 Genomic Encylopedia for Bacteriaand Archaea-Root Nodule Bacteria (GEBA-RNB) project.
机译:豆科根瘤菌trifolii SRDI943(合成V2-2)是一种好氧的,运动的,革兰氏阴性的非孢子形成棒。 SRDI943是从一年生三叶草Trifoliummichelianum savi cv的根中回收的根瘤中分离出来的。用从澳大利亚维多利亚州一个混合牧场收集的土壤接种的天堂。 SRDI943在三叶草属中具有广泛的结瘤宿主范围,但是在T.subterraneum spp上N2固定次优(参考菌株WSM1325的20-54%)。在这里,我们描述了豆科植物R.leguminosarum bv的特征。三叶草菌株SRDI943,以及基因组序列信息和注释。将7,412,387 bp的高质量草图基因组分为5个重叠群的5个支架,包含7,317个蛋白质编码基因和89个仅RNA编码基因,并且是美国能源部联合基因组研究所2010细菌和细菌基因组研究的100个根瘤菌基因组序列之一。古细菌根瘤细菌(GEBA-RNB)项目。

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